解：（1）、染色體是細胞核內(nèi)的染色質(zhì)經(jīng)過高度螺旋化形成的結(jié)構(gòu)，它是由DNA和蛋白質(zhì)組成的．基因一個是有特定遺傳信息的DNA片段，一個DNA上有多個基因，生物的某個具體性狀是由基因控制的，基因是決定生物性狀的最小單位．據(jù)此可知，真菌的性狀特征是由其DNA分子上的基因決定的．
（2）、分析人們對真菌與植物、動物關(guān)系認識的演變歷程可以看出，對真菌與植物、動物關(guān)系認識受到當時科技發(fā)展水平的限制，把真菌歸為了植物，后又理解為近親，隨著分子遺傳學研究等新證據(jù)的出現(xiàn)人們對其認識發(fā)生了改變，認為真菌與動物的關(guān)系密切，等等這些說明科學知識不是一成不變的，需要不斷的完善和修正．故選：ABC
故答案為：（1）基因
（2）ABC
分析：此題主要考查的是基因控制生物的性狀的知識，還涉及對真菌的認識、分類、與植物、動物關(guān)系的演變歷程，分析解答．
點評：解答此題的關(guān)鍵是明確生物的性狀是由基因控制的，并了解人們認識真菌與植物、動物關(guān)系的演變歷程．
